Chii a été enlevée ! Effrayé à l’idée que sa mémoire soit réinitialisée par son ravisseur, Hideki cherche du soutien auprès de Shinbo, qui l’enjoint au calme. Mais le passé tragique du patron de Chii, venu prêter main-forte à l’étudiant dans ses recherches, le conforte au contraire dans ses inquiétudes. Bien décidé à remuer ciel et terre pour la retrouver, Hideki arpente la ville, guidé par Minoru ainsi que par un mystérieux informateur. Mais le temps est compté : le ravisseur de Chii  est persuadé d’avoir mis la main sur l’un des légendaires Chobits. Et il fera tout pour percer ses secrets.