Alice et ses amis quittent Hexardoria à la recherche de Kagami, qui n'est toujours pas rentré de la mystérieuse "phase suivante", après trois ans d'absence.

Ils se réveillent dans un lieu à la fois étrange et familier, accueillis par l'énigmatique Kurusu Saijo, qui leur apprend une vérité des plus surprenantes !